Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4177883	4178335	453	65 [0]	[0] 9	[gspJ]–[gspI]	[gspJ],[gspI]

GTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAG  >  W3110S.gb/4177818‑4177882                                                                 | gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:541754/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1030258/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1819705/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1863423/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:227226/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:229252/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:230539/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:25763/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:298966/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:375651/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:385247/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:425038/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:483246/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:504404/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:50779/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:524007/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1784436/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:550940/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:591980/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:595208/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:597557/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:605839/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:618359/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:654508/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:6662/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:676236/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:726632/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:782362/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:791449/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:800558/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:878759/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:943807/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:142504/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1070800/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1072107/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1095922/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1111218/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1190567/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1223325/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1229880/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1244926/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1264896/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1301510/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1343334/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1344784/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1351159/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1400310/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1776041/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1586924/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:177212/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1739119/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1712947/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1686369/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1645491/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1464544/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1511060/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1498715/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1496217/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1472680/65‑1 (MQ=255) gTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1471151/65‑1 (MQ=255)  tAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:40003/64‑1 (MQ=255)                           cATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:671533/39‑1 (MQ=255)                           cATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1392107/39‑1 (MQ=255)                            aTGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1704479/38‑1 (MQ=255)                               aTTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAg  <  1:1689455/35‑1 (MQ=255)                                                                 | GTAAAAATAGCTTCTTCACCCAACACCATGATTTTGTCCGTACTCCGATTCCTCCGGGCGACCAG  >  W3110S.gb/4177818‑4177882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑