Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4275006	4275028	23	36 [0]	[0] 2	uvrA	ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC

CGCCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGT  >  W3110S.gb/4274941‑4275005                                                                 | cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:803869/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:274137/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:286555/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:293144/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:297307/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:475936/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:571386/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:588305/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:788107/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1885861/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:808801/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:813030/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:840670/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:895410/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:918937/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:945449/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:980809/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:987244/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1565307/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1198315/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1205321/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1210043/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1358713/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1376464/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1419853/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1423731/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1552463/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1196324/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1593558/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1611666/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1744058/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1793932/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:1799478/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:180081/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:183849/1‑65 (MQ=255) cgcCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGt  >  1:186145/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGCCAGCTTCACGCGCTGGGCTTCACCGCCTGAAAGGGTGGTTGCGGACTGCCCCAGTCGAATGT  >  W3110S.gb/4274941‑4275005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑