Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4281086	4281234	149	27 [0]	[0] 46	soxR	DNA‑binding transcriptional dual regulator, Fe‑S center for redox‑sensing

GAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTA  >  W3110S.gb/4281022‑4281085                                                                | gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1455274/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:909561/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:909321/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:748617/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:714936/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:63887/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:541778/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:452689/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:345077/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:31486/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:3019/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:270240/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:26552/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:203461/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1853237/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1805176/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1778895/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1765749/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1723684/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:165622/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1569574/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1561694/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:151168/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1475339/64‑1 (MQ=255) gAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1318187/64‑1 (MQ=255)  aGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1877903/63‑1 (MQ=255)  aGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTa  <  1:1683782/63‑1 (MQ=255)                                                                | GAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGATTTATGGAAAAGAAATTACCCCGCATTA  >  W3110S.gb/4281022‑4281085

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑