Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4285906	4285923	18	36 [0]	[0] 22	yjcF	conserved hypothetical protein

AAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGC  >  W3110S.gb/4285841‑4285905                                                                 | aaGCTAATGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:449975/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:525872/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1823179/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1824991/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:215113/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:244470/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:290418/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:365551/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:391491/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1818304/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:539073/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:600557/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:610434/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:684846/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:75922/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:925084/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:938583/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:961554/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1482613/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1063458/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1121433/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1244682/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:125699/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1336532/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1419788/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1008115/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1537753/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1611964/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:165043/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:16961/65‑1 (MQ=255) aaGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1782658/65‑1 (MQ=255)  aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1342354/64‑1 (MQ=255)  aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1727360/64‑1 (MQ=255)  aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:173763/64‑1 (MQ=255)  aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1068765/64‑1 (MQ=255)  aGCTAAGGTAGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGc  <  1:1522729/64‑1 (MQ=255)                                                                 | AAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGC  >  W3110S.gb/4285841‑4285905

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑