Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4285989	4286051	63	30 [0]	[0] 4	yjcF	conserved hypothetical protein

ATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAA  >  W3110S.gb/4285924‑4285988                                                                 | aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:22267/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:936662/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:898058/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:891525/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:87661/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:719321/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:626548/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:606502/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:300827/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:229176/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:100682/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:201233/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1780952/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1618751/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1557919/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1555605/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1170871/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:128522/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1302354/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1482628/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1305068/65‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1366323/65‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1580739/64‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:758328/64‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:622991/64‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:615771/64‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:450063/64‑1 (MQ=255)  tttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1511846/64‑1 (MQ=255)   ttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:325429/63‑1 (MQ=255)   ttGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGaa  <  1:1150040/63‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAA  >  W3110S.gb/4285924‑4285988

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑