Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4294373	4294397	25	11 [0]	[0] 55	nrfD	formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit

TTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCA  >  W3110S.gb/4294308‑4294372                                                                 | ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1211134/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1243830/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1252514/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1315402/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1389560/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1526695/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1781689/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:178666/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:1877507/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:251777/1‑65 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCa  >  1:258621/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCA  >  W3110S.gb/4294308‑4294372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑