Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4295322	4295357	36	55 [0]	[0] 49	nrfE	heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE

ATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGGG  >  W3110S.gb/4295257‑4295321                                                                 | aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:598268/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:221313/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1007688/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:318971/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:405131/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:410630/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:422331/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:432525/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:465759/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:492267/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:537087/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:54749/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:547888/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:225165/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:639436/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:665436/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:682398/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:698343/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:746544/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:891878/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:914676/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:939146/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:947219/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:955937/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:958040/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1334053/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1012254/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1035756/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1037758/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1072716/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1092864/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1096394/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1156946/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1210595/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1289995/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1291183/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1302605/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:187355/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1455494/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1492038/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1494102/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1649007/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1662827/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1720492/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1735144/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1751176/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1766632/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1768739/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1785306/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:1847951/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGCgggg  <  1:693959/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCCTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:413779/65‑1 (MQ=255) aTTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGGCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:401732/65‑1 (MQ=255) aTTTATGCCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:922162/65‑1 (MQ=255)      tGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTgggg  <  1:931928/60‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGGG  >  W3110S.gb/4295257‑4295321

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑