Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4296088	4296139	52	47 [0]	[0] 123	nrfE	heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE

CGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTA  >  W3110S.gb/4296023‑4296087                                                                 | cGTCTCTGGCTCTGTATTGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1045577/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:61985/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:293384/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:310609/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:318299/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:356482/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:360269/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:371218/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:391393/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:520428/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:566262/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:60185/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:218914/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:630256/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:676663/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:756829/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:795879/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:810087/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:836106/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:838051/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:875724/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:935979/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:978066/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:997476/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1539581/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1103599/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1131563/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1242923/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1311288/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1334076/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1336760/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1343942/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1441347/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1466/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1530471/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:275449/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1571302/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1603482/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1694076/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1725108/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1785135/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1796820/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1825521/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:185803/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:193930/1‑65 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGT‑GCCCGGCCGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1290241/1‑64 (MQ=255) cGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAACGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTa  >  1:1819701/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTA  >  W3110S.gb/4296023‑4296087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑