Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4313537	4313540	4	70 [0]	[0] 97	alsC	D‑allose transporter subunit

CACCAGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTG  >  W3110S.gb/4313472‑4313536                                                                 | caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:428084/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:676515/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:644962/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:635886/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:55598/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:529803/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:495396/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:480617/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:434429/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:745564/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:424365/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:418595/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:396987/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:337277/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:334387/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1037476/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:303089/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:314368/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:763099/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:773119/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:821819/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:834538/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:866213/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:878329/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:880419/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:915475/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:936515/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:94929/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:955190/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:959582/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:968284/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:972109/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:985831/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1511596/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1071109/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1081546/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1163842/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1218826/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1290815/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1291082/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1292250/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1295473/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1308437/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1457071/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1465906/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1471735/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1511285/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:266909/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1515955/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1519179/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:231702/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:159208/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1636556/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1637069/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1650797/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:222694/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:206103/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1801151/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1675739/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1723737/65‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1741586/65‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:676364/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:261182/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:877275/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:735761/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:615408/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGGCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:313777/64‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTCCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1323635/64‑1 (MQ=255)              aaTTTCACGTCAATCCCTGAATAGATCGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:14540/52‑1 (MQ=255)                tttCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTg  <  1:1268431/50‑1 (MQ=255)                                                                 | CACCAGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCAGTG  >  W3110S.gb/4313472‑4313536

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑