Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	405562	405682	121	68 [0]	[0] 19	[aroL]	[aroL]

GGTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTG  >  W3110S.gb/405499‑405561                                                               | ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAGTTGTACTAGTTTg  <  1:419712/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:551119/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1779903/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:102962/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1881124/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1884950/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:201237/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:224320/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:303957/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:308651/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:373412/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:40572/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:477134/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:479272/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:508883/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:532869/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1816786/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:558415/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:582605/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:667928/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:745627/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:762554/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:766681/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:809325/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:881717/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:91812/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:925983/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:951755/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:951958/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:953260/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:982492/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:993336/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1414126/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1029751/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1037928/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1047062/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1048992/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1051564/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1093078/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1093354/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1169185/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1200343/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1230782/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1237301/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1241448/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:125620/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1272799/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1425765/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1481190/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1680594/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1664740/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1649931/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1637542/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1631533/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:155088/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:154247/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1512669/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1501800/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1492273/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1490931/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1490020/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1456253/63‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTT‑‑AATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:789283/61‑1 (MQ=255) ggTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTCTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:1779736/63‑1 (MQ=255)   tgtATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:427045/61‑1 (MQ=255)    gtATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:954165/60‑1 (MQ=255)           gaTTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:640724/53‑1 (MQ=255)                          tGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTg  <  1:170829/38‑1 (MQ=255)                                                               | GGTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTG  >  W3110S.gb/405499‑405561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑