Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4378313	4378341	29	49 [0]	[0] 16	yjeJ	hypothetical protein

CGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAA  >  W3110S.gb/4378248‑4378312                                                                 | cGGCGTTGCTTCACTCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:19354/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:598357/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1856810/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:247057/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:342361/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:393229/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:424477/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:433684/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:457677/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:461745/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:540902/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:55704/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1813657/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:602451/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:610175/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:614661/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:615272/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:622203/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:691564/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:721905/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:727970/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:748367/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:917977/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:936659/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1410895/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1011649/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1012243/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:101452/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1039737/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1138031/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1184383/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1202263/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1251695/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1258791/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1371864/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:138825/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1001044/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1531173/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:160759/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1622201/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1649774/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1663656/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1667964/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1701919/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1737286/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1765082/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1786846/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGGTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:1269274/1‑65 (MQ=255) cGGCGTTGCTTCACGCGGTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTaa  >  1:452203/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAA  >  W3110S.gb/4378248‑4378312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑