Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4429221	4429298	78	51 [0]	[0] 8	yjfY	hypothetical protein

GCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGG  >  W3110S.gb/4429156‑4429220                                                                 | gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCTTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1808851/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:392231/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:286386/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1013610/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:304625/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:313370/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:33688/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:336990/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:363291/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:372269/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:379904/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:382955/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:291115/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:41258/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:506213/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:547152/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:725394/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:739132/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:756938/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:902782/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:946805/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:95837/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:986479/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:988438/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1437763/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1036244/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1065759/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1095060/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1189715/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1191773/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1327364/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:137408/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1434521/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1438792/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1754542/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:223218/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:218358/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1861006/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1829186/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1809076/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1806205/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1782434/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1513622/65‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATCGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:25953/65‑1 (MQ=255)  caaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:699804/64‑1 (MQ=255)  caaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:608793/64‑1 (MQ=255)  caaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:892131/64‑1 (MQ=255)  caaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1839869/64‑1 (MQ=255)  caaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:986199/64‑1 (MQ=255)                 cAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:424738/49‑1 (MQ=255)                             ggTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTgg  <  1:1334560/37‑1 (MQ=255)                                                                 | GCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGG  >  W3110S.gb/4429156‑4429220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑