Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4446558	4446724	167	30 [0]	[0] 112	msrA	methionine sulfoxide reductase A

CGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGT  >  W3110S.gb/4446495‑4446557                                                               | cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:180150/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:868107/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:77580/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:762096/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:691858/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:643218/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:589672/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:431805/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:393723/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:222149/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:196424/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1839022/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1833140/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1031435/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1693999/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1649802/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1606108/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1593783/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1484853/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1454540/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1412261/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1337234/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1236849/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1193493/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1180598/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1125836/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1106088/63‑1 (MQ=255) cGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGATCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:1121125/63‑1 (MQ=255)             tctcCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:865510/51‑1 (MQ=255)                      aTACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGt  <  1:854226/42‑1 (MQ=255)                                                               | CGGGATCGTGATTCTCCCAAAATACCTGTAGCAACTGCTCATAGCTGATGACGGAAGGATCGT  >  W3110S.gb/4446495‑4446557

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑