Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4448100	4448116	17	63 [0]	[0] 16	ytfM	predicted outer membrane protein and surface antigen

GGAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACT  >  W3110S.gb/4448035‑4448099                                                                 | ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGGACGATACCGAATCTGACt  <  1:1484129/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:45223/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1049043/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1874776/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:234194/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:257965/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:341187/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:354214/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:371000/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:387700/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:391047/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:410250/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:410534/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:431044/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:433375/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1835831/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:482330/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:53012/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:612810/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:613089/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:639434/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:686280/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:692273/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:708566/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:735269/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:73659/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:792005/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:87475/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:988247/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:996099/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1405525/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1054534/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1057583/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1065857/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1123816/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1133875/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1206679/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1220089/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1279137/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1280362/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1288564/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1334588/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1342123/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1364303/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1366300/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:18267/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1668775/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:182527/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1819455/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1760038/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1737853/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1424766/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1666399/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1587246/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1576313/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1482061/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1456376/65‑1 (MQ=255) ggAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1443058/65‑1 (MQ=255)  gAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:254123/64‑1 (MQ=255)  gAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1168482/64‑1 (MQ=255)  gAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1837083/64‑1 (MQ=255)  gAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:443580/64‑1 (MQ=255)                           gTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACt  <  1:1837664/39‑1 (MQ=255)                                                                 | GGAACAATATTATTTGGTGCAGGGCGGTTTTAAGCGCACTGACCTGAACGATACCGAATCTGACT  >  W3110S.gb/4448035‑4448099

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑