Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4450513	4450539	27	43 [0]	[0] 27	ytfN	conserved hypothetical protein

CGCTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCCA  >  W3110S.gb/4450448‑4450512                                                                 | cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:584462/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1724592/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1027329/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1763099/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1764571/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1789029/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:181172/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:231684/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:335258/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:527156/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1746975/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:622385/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:677994/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:86883/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:871129/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:892344/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:924715/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:93393/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:95432/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:169040/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1092818/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1126683/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1136812/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1162980/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1248897/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1252091/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1276312/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1278337/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1289876/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1375222/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1391765/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1429489/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1461529/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1544636/65‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1710456/65‑1 (MQ=255)  gcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:270259/64‑1 (MQ=255)  gcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:488113/64‑1 (MQ=255)  gcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:55945/64‑1 (MQ=255)  gcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1857598/64‑1 (MQ=255)  gcTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:155565/64‑1 (MQ=255)               ggCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1221663/51‑1 (MQ=255)                        gCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:1068099/42‑1 (MQ=255)                               ggCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCca  <  1:702938/35‑1 (MQ=255)                                                                 | CGCTGCCGGGGCTTGGCGGTACAGCGAAAGGGCTGGTGAAAGTACGCGGCACGGTGGAAGCGCCA  >  W3110S.gb/4450448‑4450512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑