Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	418203	418394	192	73 [0]	[0] 67	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

CTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCGG  >  W3110S.gb/418138‑418202                                                                 | cTGGCAGCGATTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:774143/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAATATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:778792/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:485374/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:57563/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:553903/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:537991/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:518984/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:518209/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:512839/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:506056/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:501445/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:595972/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:438085/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:416661/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:389065/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:350838/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:345485/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1069209/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:279613/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:594104/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:327346/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:623328/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:628001/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:659372/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:719346/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:73851/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:768764/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:778252/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:793227/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:826300/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:849621/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:912119/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:957129/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:961042/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:987437/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1261692/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:148232/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1477529/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:212950/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:142695/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1413663/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1355564/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1341560/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1281362/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1470732/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1200117/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1167757/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1164521/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:115171/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1127425/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1095897/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1083839/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1591401/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:205632/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1869113/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1848709/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1829249/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1813298/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1787031/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1776947/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:173895/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:150381/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1549101/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1540443/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1513491/65‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1507408/65‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1345522/64‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:155917/64‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:1364520/64‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:781303/64‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:452529/64‑1 (MQ=255)  tGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:649826/64‑1 (MQ=255)                              ttAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCgg  <  1:648238/36‑1 (MQ=255)                                                                 | CTGGCAGCGAGTGCCGCACGGTGCCGAATTTAGCGTTGAAGATAACGGACCGGGCATTGCACCGG  >  W3110S.gb/418138‑418202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑