Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4492633	4492728	96	87 [0]	[0] 21	yjgQ	conserved inner membrane protein

CGCTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGAA  >  W3110S.gb/4492567‑4492632                                                                  | cGCTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGA‑CCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:338591/65‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:306290/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:530793/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:527631/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:510490/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:432032/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:418412/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:38478/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:359173/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:337642/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:334590/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:545905/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:290617/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:287080/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:282027/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:257876/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:247617/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:235744/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:224578/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1024158/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1861866/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:774055/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:944320/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:942261/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:927961/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:873268/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:86338/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:854651/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:851328/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:847534/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:79358/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:779302/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1865443/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:738171/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:710485/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:703827/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:695686/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:647839/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:632120/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:58454/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:577270/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:563893/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1215116/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1824446/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1401084/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1390586/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:135665/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1329214/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1295918/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1286791/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1283764/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1251864/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1229342/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1432421/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1187479/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1179871/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1177086/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1138533/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1134635/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1131616/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1121404/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1117279/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1116860/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1039777/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1650759/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1813/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1811525/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1799640/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1782137/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1677837/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1666625/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1473496/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1640925/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:163629/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1625471/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1580950/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:157981/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1521831/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1519115/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1509228/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1484696/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:1479693/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTAGATGaa  <  1:287490/64‑1 (MQ=255)   cTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGGCGCAGGTTGATGaa  <  1:88551/64‑1 (MQ=255)                       ttGACCGGGATCATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:231019/44‑1 (MQ=38)                       ttGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:168544/44‑1 (MQ=255)                                taCATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGaa  <  1:905919/34‑1 (MQ=255)                                                                  | CGCTATGCCGCTACTGCGAAGTTTGACCCGGAACATAAAGTCTGGCGTCTGTCGCAGGTTGATGAA  >  W3110S.gb/4492567‑4492632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑