Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4502119 4502185 67 119 [0] [1] 86 intB predicted integrase

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

CTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCG  >  W3110S.gb/4502056‑4502118
                                                              |
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:365977/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:553338/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:534977/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:518341/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:51475/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:491831/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:478887/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:470149/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:470093/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:45196/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:380520/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:378121/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:56851/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:361951/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:361008/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:353071/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:348834/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:340447/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:335732/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:322331/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:287344/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:281950/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1020780/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:277632/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:743128/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:961283/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:951047/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:945075/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:93705/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:932921/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:92618/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:915924/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:880856/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:854258/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:779296/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:774537/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:280707/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:738409/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:709834/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:676529/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:670517/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:663803/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:657356/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:657180/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:642472/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:632503/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:612247/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:57673/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1182424/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1442807/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:143207/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:265858/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1411479/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1378987/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1367792/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1366092/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1307765/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1235768/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1232536/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1214131/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1412071/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1176378/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1144431/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1132736/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1110256/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1096045/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1094690/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:108178/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1075875/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1072337/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1029099/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1024828/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1754049/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:246047/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:239640/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:235878/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:235859/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:211186/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1861733/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1839130/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1822306/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1449626/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1739639/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1675846/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1650492/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1586896/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1561091/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1530052/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1520889/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1490809/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1471842/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATATCGAAGCg  <  1:1386519/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTAGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1825405/63‑1 (MQ=255)
cTGATCTTTACTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:645534/63‑1 (MQ=255)
 tGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:356494/62‑1 (MQ=255)
  gATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1300887/61‑1 (MQ=255)
                   gTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1870985/44‑1 (MQ=255)
                   gTGAGCGGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:1498391/44‑1 (MQ=255)
                       gCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:936109/40‑1 (MQ=255)
                         tGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCg  <  1:809150/38‑1 (MQ=255)
                                                              |
CTGATCTTTATTCGGTCCAGTGAGCTGCGTTTTGCTCGTTGGTCAGAGATCGATTTCGAAGCG  >  W3110S.gb/4502056‑4502118

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑