Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4523088 4523284–4523262 175–197 63 [0] [0] 29 [insA] [insA]

GTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGG  >  W3110S.gb/4523023‑4523087
                                                                |
gttTTTCTAAGTGTTATTAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1110237/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:410115/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:56474/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:564142/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:561603/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:515741/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:469530/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:467346/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:464862/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:42834/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:579771/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:357843/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:309086/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:287581/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:280991/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:267037/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:264865/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1057954/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:606431/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:622758/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:625354/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:630674/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:696340/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:700654/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:729000/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:738625/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:84139/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:843100/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:867127/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:910594/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:918834/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:940771/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:137285/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1038912/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1089077/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:11046/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1110788/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1121288/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1127719/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1129471/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1181342/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1189694/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1246674/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1257974/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1272334/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1272626/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1608868/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:214680/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1865135/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1815753/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1776409/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1764847/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1698360/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1659973/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:163416/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1392438/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1543119/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1506384/65‑1 (MQ=255)
gttTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTATGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1432519/65‑1 (MQ=255)
 tttttCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:610999/64‑1 (MQ=255)
  ttttCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:1223336/63‑1 (MQ=255)
                   ggtaggtaTAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:143746/46‑1 (MQ=255)
                       ggtaTAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCgg  <  1:21771/42‑1 (MQ=255)
                                                                |
GTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGG  >  W3110S.gb/4523023‑4523087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: