Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4542084	4542121	38	74 [0]	[0] 4	yjhS	conserved hypothetical protein

ATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCA  >  W3110S.gb/4542019‑4542083                                                                 | atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:550853/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:700338/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:686889/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:685097/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:677053/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:635693/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:631836/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:578654/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:571026/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:559589/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:737877/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:527761/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:505837/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:502183/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:498425/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:444749/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:444333/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:430930/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:39493/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:853789/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:967341/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:941173/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:939568/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:938668/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:934088/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:931175/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:923520/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:886501/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:380041/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:837580/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:82868/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:818386/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:812738/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:797536/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:782118/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:768889/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:753765/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1160081/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1444712/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1411492/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1316610/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1310451/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1282926/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:126374/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1245540/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1211083/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:119622/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1523230/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1147612/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:112602/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1108979/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1100421/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:10860/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1075541/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1060685/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1029816/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1753691/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:340559/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:328493/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:262808/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:234711/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:184397/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1804564/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1784136/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1775796/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1020192/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1724911/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1711719/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1679397/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1614898/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1605287/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1594712/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1561082/1‑65 (MQ=255) atgatTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCa  >  1:1537437/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCA  >  W3110S.gb/4542019‑4542083

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑