Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4551897	4551996	100	12 [0]	[0] 21	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

CCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATG  >  W3110S.gb/4551832‑4551896                                                                 | ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:1391207/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:1482129/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:1675113/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:30269/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:365174/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:41284/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:499993/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:693811/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:974247/65‑1 (MQ=255) ccATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGGACTGGCGCATGCCAATg  <  1:1534440/65‑1 (MQ=255)  cATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:139587/64‑1 (MQ=255)                       ctctATTACGGAGTCCGCGGGGGGGTACTGGCTCATGCCAATg  <  1:579201/43‑1 (MQ=255)                                                                 | CCATAGCGATGATATTAAGCAGCTCTATTACGGAGTCAGCGGTGGGGTACTGGCTCATGCCAATG  >  W3110S.gb/4551832‑4551896

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑