Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4567692 4568213 522 102 [0] [0] 6 yjiK conserved hypothetical protein

Only 100 of 102 total aligned reads displayed.

ACCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCG  >  W3110S.gb/4567627‑4567691
                                                                |
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:422204/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:564099/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:545745/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:540262/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:53460/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:523225/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:513385/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:511499/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:503614/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:503193/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:480040/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:47952/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:567672/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:41625/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:339135/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:338940/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:317998/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:284342/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:248922/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:245907/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:202523/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1873033/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:101181/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1834251/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:777534/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:967590/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:950167/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:942638/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:898704/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:890428/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:880524/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:864157/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:851548/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:841166/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:839968/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:827136/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1853076/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:761807/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:749200/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:741364/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:694169/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:691754/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:675025/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:660143/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:616411/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:601756/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:600839/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:597533/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1282300/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1456161/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1447475/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1444640/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:143218/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1430373/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1418868/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1401312/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1362366/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1362240/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1317817/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1296891/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1288533/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:178583/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1230755/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1167623/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1147945/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1146210/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1143680/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1116288/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1102419/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1077072/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1039797/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1030608/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1014701/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:166298/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:182966/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1772753/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1759135/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1751900/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1746892/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1730194/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1691891/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1668927/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1623042/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1575271/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1519883/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1512017/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1499338/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1496473/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1474414/65‑1 (MQ=255)
aCCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1460059/65‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:468019/64‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1457916/64‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:368621/64‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:261252/64‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1067549/64‑1 (MQ=255)
 ccAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:17773/64‑1 (MQ=255)
  cAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1678721/63‑1 (MQ=255)
            tttttttGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1458530/53‑1 (MQ=255)
                        ttAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:558586/41‑1 (MQ=255)
                            aTTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCg  <  1:1300739/37‑1 (MQ=255)
                                                                |
ACCAGAAGCGTATTTTTTTGCTGGTTAAATTCTGCGCCGGACACATCATCTAAAGTAAATTGCCG  >  W3110S.gb/4567627‑4567691

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: