Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4578250	4578265	16	15 [0]	[0] 85	yjiT	conserved hypothetical protein

ATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAT  >  W3110S.gb/4578185‑4578249                                                                 | atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1042483/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1205488/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1234744/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1506660/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1674754/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:17309/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:1879935/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:318832/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:457369/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:739847/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:751505/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:811148/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:879992/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:942332/1‑65 (MQ=255) atTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTCGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAt  >  1:78255/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAT  >  W3110S.gb/4578185‑4578249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑