Missing coverage evidence...
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CCCCCCGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGT  >  W3110S.gb/4595868‑4595932                                                                 | ccgcccGACGTAATGCAGCTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:331/4‑65 (MQ=255) ccccccGCCGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1187230/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCATCTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1782264/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:539482/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1745170/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1749358/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1781495/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1821002/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1825657/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:370307/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:4086/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:454434/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:482089/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1607156/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:552066/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:616087/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:623313/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:623531/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:657341/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:723806/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:747513/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:820737/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:841315/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:956395/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1346728/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1033599/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1040910/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1055411/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1055969/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:10561/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1058438/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1084699/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1162244/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1323239/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1323410/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:103105/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1365157/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1382099/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1444118/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1456338/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1457898/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1472010/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1538357/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1591235/1‑65 (MQ=255) ccccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1605818/1‑65 (MQ=255) caccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:1473406/3‑65 (MQ=255) acccccGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGt  >  1:810765/2‑65 (MQ=255)                                                                 | CCCCCCGACGTAATGCAACTACCGCGAGGCAGAATGCACCGATGATTCCGAGAATCACCCAGGGT  >  W3110S.gb/4595868‑4595932

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑