Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4609164	4609225	62	45 [0]	[0] 14	bglJ	DNA‑binding transcriptional regulator

ATTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAT  >  W3110S.gb/4609115‑4609163                                                 | aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTTGCCAt  <  1:1146769/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:716156/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:426427/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:464387/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:512975/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:533190/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:572538/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:578135/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:597328/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:610679/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:694743/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:696010/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:70001/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:364322/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:716894/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:814960/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:862693/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:868164/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:880169/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:911020/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:914723/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:971610/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:97331/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1015239/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1064043/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1090432/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1114115/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1120552/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1137462/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1196591/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1246048/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1248179/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1275318/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1373543/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1653007/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1776746/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1779268/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:250656/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:279202/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:303630/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:33074/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:331424/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:332192/49‑1 (MQ=255) aTTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:408224/49‑1 (MQ=255)             gatATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAt  <  1:1021354/37‑1 (MQ=255)                                                 | ATTGCGGATGATGATATTGAAGCTCGGCTGATTGGTTCATTGTCGCCAT  >  W3110S.gb/4609115‑4609163

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑