Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4616239 4616464 226 103 [0] [0] 12 osmY periplasmic protein

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

CAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAT  >  W3110S.gb/4616174‑4616238
                                                                |
cggACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1477382/63‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:350405/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:629696/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:595345/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:59406/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:579939/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:55730/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:453343/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:448065/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:406820/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:374810/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:359361/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:224061/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:342108/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:331541/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:325427/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:323901/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:302469/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:273349/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:268499/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1003747/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:259359/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:24173/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:261042/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:805097/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:969718/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:965307/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:964407/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:952141/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:943754/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:940207/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:93353/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:912170/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:873518/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:822894/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:640768/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:776806/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:775758/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:759912/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:729849/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:716329/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:708721/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:691469/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:69055/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:677899/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:666810/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1390016/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1601555/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1597803/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1595000/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1530024/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1502120/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1481742/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1475845/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1451563/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1881159/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1339859/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1273691/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1173953/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:108101/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1075837/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1040232/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1021920/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1640713/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1757476/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1848406/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1650921/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1658644/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1705921/65‑1 (MQ=255)
cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1835814/65‑1 (MQ=255)
cAGAATACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTATTTTCAt  <  1:1047510/65‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1847953/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:126528/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1177781/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:793335/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:803837/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1806361/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1141282/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1132066/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:380317/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1051031/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1027387/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1022795/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:214254/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:764938/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1268894/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:284151/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1411503/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:311354/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:312827/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1691121/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1499441/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1527244/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1532546/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:450513/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1648457/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:409173/64‑1 (MQ=255)
 aGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1627664/64‑1 (MQ=255)
     tACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1419142/60‑1 (MQ=255)
                  gcAGGGGAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAt  <  1:1296629/47‑1 (MQ=255)
                                                                |
CAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAATTTCAT  >  W3110S.gb/4616174‑4616238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑