Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1358	1372	15	50 [0]	[0] 2	thrA	fused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I

CGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAC  >  W3110S.gb/1293‑1357                                                                 | cgattCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:240642/4‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:61086/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:257597/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:275805/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:378580/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:39514/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:404973/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:406964/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:420564/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:467419/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:470702/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:520062/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:585033/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:207496/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:659356/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:738928/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:745222/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:808554/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:915849/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:933728/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:935849/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:95424/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:960751/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:968307/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:99585/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1567513/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1079273/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1166775/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1214753/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1235843/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1249557/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1305127/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1311761/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1330656/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1429497/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1468498/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:15650/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1051481/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1581474/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1584015/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1669986/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1679111/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1704508/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1733859/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1774026/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:182284/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:193477/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:195273/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTCCAGCGATGTCAc  >  1:1146955/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGAGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAc  >  1:1819249/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGTTTCTGGTCCGGGGATGAAAGGGATGGTCGGCATGGCGGCGCGCGTCTTTGCAGCGATGTCAC  >  W3110S.gb/1293‑1357

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑