Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4113	4610	498	39 [0]	[0] 48	thrC	threonine synthase

ATTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAG  >  W3110S.gb/4048‑4112                                                                 | aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACATATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:344836/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:529951/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:258968/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:269973/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:359690/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:407424/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:416533/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:447021/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:476398/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:486661/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1839540/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:544125/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:663186/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:667922/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:797802/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:799123/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:886967/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:903642/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:906969/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1287411/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1068998/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1071049/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1125295/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1160357/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1171878/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1239784/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1256599/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1258666/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1067117/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1470260/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1511330/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1599215/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1612036/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1675116/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1676726/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:170708/65‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:171302/65‑1 (MQ=255)  tttAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:835638/64‑1 (MQ=255)                            ggCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAg  <  1:1474835/38‑1 (MQ=255)                                                                 | ATTTAAAGATTTCGGCGGTCGCTTTATGGCACAAATGCTGACCCATATTGCGGGTGATAAGCCAG  >  W3110S.gb/4048‑4112

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑