Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4676	4850	175	59 [0]	[0] 125	thrC	threonine synthase

CTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAAGAG  >  W3110S.gb/4611‑4675                                                                 | cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:744615/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:327282/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:412688/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:438720/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:445932/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:486175/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:507398/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:535819/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:541317/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:647829/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:649952/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:6623/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:72125/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:330787/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:774632/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:781213/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:787628/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:793346/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:798792/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:816366/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:873716/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:874394/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:893126/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:951257/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:959997/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:984046/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1680364/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1076406/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1158784/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1214375/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1268979/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:143065/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1430908/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1467633/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1471565/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1483891/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1546175/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1604384/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1663010/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1681823/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:20545/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1714296/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:174575/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1750474/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1820662/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1853834/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:194464/65‑1 (MQ=255) cTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCCTGTGGAagag  <  1:1691576/65‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:587342/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1016427/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:125995/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:417009/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:562133/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:279492/64‑1 (MQ=255)  tCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGGCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:1373107/64‑1 (MQ=255)       cGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:982318/59‑1 (MQ=255)            ttATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:301965/54‑1 (MQ=255)                ccAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGGagag  <  1:237033/50‑1 (MQ=255)                     gcgATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAagag  <  1:682789/45‑1 (MQ=255)                                                                 | CTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGGACGTGAGTCAGCCGAACAACTGGCCGCGTGTGGAAGAG  >  W3110S.gb/4611‑4675

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑