Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	491628	491703	76	96 [0]	[0] 55	dnaX	DNA polymerase III/DNA elongation factor III, tau and gamma subunits

GCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATACC  >  W3110S.gb/491564‑491627                                                                | gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGTACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:445626/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:271487/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:461514/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:42301/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:409001/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:402305/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:36153/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:337664/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:335285/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:333244/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:290284/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:282593/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:463424/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:224490/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:219110/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1886481/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1862635/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1828269/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1825175/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1793878/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1113103/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1784183/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:176174/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:631559/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:998652/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:917015/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:910374/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:905868/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:884678/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:872308/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:804604/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:795090/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:659640/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:659582/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:658764/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1792995/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:618306/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:60819/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:600132/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:586423/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:582867/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:570334/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:531309/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:512539/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:489028/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:472358/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1305332/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1399197/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1394942/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1387126/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:138623/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:137374/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1365442/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1352883/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1341541/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1321581/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:131280/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1756103/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1304073/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1301893/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1273070/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1223624/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1213565/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1208547/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1200772/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1156717/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:115105/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1146544/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1708011/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1758448/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1750087/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1741372/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:173013/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1729594/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1727769/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:172224/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1403185/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1707785/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1698024/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1612795/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1419775/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1503959/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1530155/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1555753/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1652445/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1617063/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1619324/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1640229/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1646196/64‑1 (MQ=255) gCAGGGGCGCTTTGTCGACCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:821750/64‑1 (MQ=255)  cAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCTCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1882585/63‑1 (MQ=255)  cAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:68240/63‑1 (MQ=255)  cAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:1205667/63‑1 (MQ=255)  cAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:482940/63‑1 (MQ=255)   aGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:118189/62‑1 (MQ=255)                        ttGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATAcc  <  1:698201/41‑1 (MQ=255)                                                                | GCAGGGGCGCTTTGTCGATCTGATTGAAATCGACGCCGCCTCGCGCACCAAAGTTGAAGATACC  >  W3110S.gb/491564‑491627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑