Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	506100	506186	87	68 [0]	[0] 11	ybaK	conserved hypothetical protein

ACCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAG  >  W3110S.gb/506035‑506099                                                                 | aCCATCGGCTCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:566174/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:298688/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1751919/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1761334/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1763486/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:87205/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1787275/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:871516/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1832474/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:853667/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:826541/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1876396/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:205737/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:235727/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:296278/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1750017/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:348198/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:813903/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:382889/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:737586/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:415042/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:445232/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:485531/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:488545/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:491481/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:622200/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:656995/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:689912/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1376928/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:989565/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1048209/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:953199/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1136809/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1179068/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1181008/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1200696/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1239370/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1241567/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1245166/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1293705/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:130739/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1349017/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1387359/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1407067/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1416254/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1421567/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1427964/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1452095/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:917310/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1474767/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:166274/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1668012/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:878912/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1744530/65‑1 (MQ=255) aCCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTATTAAGATCCAg  <  1:265551/65‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1813983/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:927739/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:387138/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:357086/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:186468/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1001732/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1785576/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1720291/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:146967/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1253142/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1108269/64‑1 (MQ=255)  ccATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1041095/64‑1 (MQ=255)                aTCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAg  <  1:1863211/50‑1 (MQ=255)                                                                 | ACCATCGGATCGGCCATCTCAACTTTCTTGGCACCCAGCGCTTTTGCTACTTTTTTAAGATCCAG  >  W3110S.gb/506035‑506099

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑