Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	543016	543047	32	12 [0]	[0] 129	ylbA	conserved hypothetical protein

CACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATA  >  W3110S.gb/542952‑543015                                                                | cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1009449/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1081464/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1087693/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1292339/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1755469/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1757785/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1760312/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:1829134/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:290126/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:473696/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:762767/64‑1 (MQ=255) cACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATa  <  1:792055/64‑1 (MQ=255)                                                                | CACCTTCGCTTAAGGCAAATGTTTTGCCTTCGGCTTTGGCAGTGATATTTCCAGAGATCACATA  >  W3110S.gb/542952‑543015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑