Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	554106	554117	12	66 [0]	[0] 160	cysS	cysteinyl‑tRNA synthetase

TATCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCG  >  W3110S.gb/554040‑554105                                                                  | tatCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCG‑AAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1000332/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATTGTGGATCg  <  1:1220435/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:574650/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1820806/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:241128/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:287704/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:325079/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:367785/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:378441/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:40676/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:429837/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:439225/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:440820/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:474912/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:535255/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:550119/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:252729/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:619640/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:626626/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:630756/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:646766/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:702395/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:795154/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:837366/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:847934/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:858313/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:874267/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:882267/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:922149/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:979790/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1473493/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1259555/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1284468/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1188206/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1335533/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1389914/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1392819/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1406526/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1162646/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1132648/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1413432/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:155268/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1588187/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1046046/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1609650/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1040352/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1741606/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1751827/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1787282/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1796567/65‑1 (MQ=255)  atCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:180711/65‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1851913/64‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1035046/64‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:845412/64‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:509031/64‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1654210/64‑1 (MQ=255)   tCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:360771/64‑1 (MQ=255)       cgacAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:974213/60‑1 (MQ=255)        gacAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1034126/59‑1 (MQ=255)          cAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1305370/57‑1 (MQ=255)               tcatcaAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:716794/52‑1 (MQ=255)               tcatcaAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1604443/52‑1 (MQ=255)                  tcaAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1252176/49‑1 (MQ=255)                          gcCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:1356147/41‑1 (MQ=255)                            cAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:672349/39‑1 (MQ=255)                             aaTGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCg  <  1:496186/38‑1 (MQ=255)                                                                  | TATCGACGACAAAATCATCAAACGCGCCAATGAAAATGGCGAAAGCTTTGTGGCGATGGTGGATCG  >  W3110S.gb/554040‑554105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑