Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559482	559730	249	30 [0]	[0] 22	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

TTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCG  >  W3110S.gb/559417‑559481                                                                 | ttACATTCCGCCTGGAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:766710/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:281429/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:806693/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:746356/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:73614/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:698377/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:684372/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:595327/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:59191/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:57499/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:447172/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:400471/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:387695/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1054316/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:193463/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1873949/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1712977/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1675277/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1660404/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1628260/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1558884/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1517750/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1345648/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:133951/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1308564/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1239802/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:115732/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:1130954/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCAACg  <  1:552/65‑1 (MQ=255) ttACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATAAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCg  <  1:555158/65‑1 (MQ=255)                                                                 | TTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCG  >  W3110S.gb/559417‑559481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑