Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559796	559882	87	20 [0]	[0] 28	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

TTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATT  >  W3110S.gb/559731‑559795                                                                 | tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:214068/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:763669/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:737374/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:717244/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:672568/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:611943/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:385574/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:363068/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:323650/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:290646/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1217877/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1849546/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1840361/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1838299/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:166477/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:163957/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1456057/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1445761/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1302283/1‑65 (MQ=255) tttATTCTTCTGATAATATGGATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAtt  >  1:1257555/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATT  >  W3110S.gb/559731‑559795

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑