Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	562378	562397	20	27 [0]	[0] 5	sfmH	predicted fimbrial‑like adhesin protein

TTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAT  >  W3110S.gb/562313‑562377                                                                 | tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1776015/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:945113/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:76217/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:755458/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:694463/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:479394/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:441327/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:440655/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:374532/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:296903/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:292286/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:189648/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1853953/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1794467/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1066013/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1733610/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1682293/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:167448/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1636753/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1532126/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1494799/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1472647/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1315617/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1168853/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1154289/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1110806/1‑65 (MQ=255) tttCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAt  >  1:1096315/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTTCTGGTCAGGCGATGGTGTCGGACAATCAGGATTTAGGTTTTATTGTCGCCGATCAGAACGAT  >  W3110S.gb/562313‑562377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑