Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	568598	568822	225	97 [0]	[0] 38	ybcK	predicted recombinase

TAGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGGAAGAA  >  W3110S.gb/568534‑568597                                                                | taccacaAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:243106/4‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCGAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:205336/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:230913/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:450188/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:444727/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:416868/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:37883/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:361564/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:329418/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:326476/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:312286/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:306284/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:277780/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:255979/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:460927/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:226726/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:202181/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:199038/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1803770/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1768455/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1767416/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1765699/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1765177/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1757704/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1753395/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:84202/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:967676/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:956874/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:945177/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:936551/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:925711/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:903608/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:901181/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:895570/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:881532/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:861992/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:858931/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1743602/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:786773/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:763083/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:720961/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:699498/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:654319/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:649473/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:596237/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:504836/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:503335/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:481350/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:480463/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1220665/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1378639/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1359645/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1307466/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1306726/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1281881/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1281460/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1281080/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1277984/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1269726/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1256341/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1232325/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1386926/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1145452/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1133498/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1131282/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1128874/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:112867/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1074112/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1068858/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1038810/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1035041/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1006477/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1006239/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:151638/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1710394/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1680324/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1664950/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1661077/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1660622/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1645241/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1618434/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1603412/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1597353/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1578359/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1550674/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1004193/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1510689/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:150690/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1481766/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1481112/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1477372/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1458353/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1456551/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1429606/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1422202/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1421477/1‑64 (MQ=255) taGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGgaagaa  >  1:1408880/1‑64 (MQ=255)                                                                | TAGCACAAAGGGCAAATGAAGAAAGCGAGATAAAGTCAAGTCGGGTTAAATTATCATGGAAGAA  >  W3110S.gb/568534‑568597

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑