Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	572388	572421	34	87 [0]	[0] 16	ybcO	hypothetical protein

AAAGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACG  >  W3110S.gb/572322‑572387                                                                  | aaaGCAGCGCGTTGTCGGGAATGCCAGGTAAGAA‑CCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:928933/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:210039/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:504490/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:40487/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:378272/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:356178/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:321136/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:316128/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:300481/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:285884/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:218564/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:5186/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:209643/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1831878/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1829174/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1813972/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1788168/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1772394/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1750797/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:744607/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:999679/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:977702/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:955109/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:943923/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:858842/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:850879/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:814769/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:774836/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1018959/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:659695/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:5952/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:586855/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:584517/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:568716/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:556406/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:546126/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1733073/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1075052/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1108506/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1115571/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:112815/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1135754/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1190784/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1194456/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1225641/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1279361/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1312631/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1317088/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1341431/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1443621/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1464538/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1502298/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:155377/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1748601/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1694319/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1673667/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1572765/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1579047/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1583986/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:164729/65‑1 (MQ=255)  aaGCAGCGCGTGGGCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1181671/65‑1 (MQ=255)   agcatcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:512859/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:755946/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:686491/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:815661/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1174039/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:921736/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1661019/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:932860/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:969596/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1015242/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:724168/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:364409/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:603719/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1215838/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1609003/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1604984/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:584459/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:135064/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1558521/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:464427/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1552801/64‑1 (MQ=255)   agcagcGCGTGGGCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:449912/64‑1 (MQ=255)         gcgTTGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1882234/58‑1 (MQ=255)            tGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:199174/55‑1 (MQ=255)             ggTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:1215426/54‑1 (MQ=255)             ggTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACg  <  1:907180/54‑1 (MQ=255)                                                                  | AAAGCAGCGCGTGGTCGGGAATGCCAGGTAAGAATCCCTGGCGTATGTAATGGCAACCCTGAAACG  >  W3110S.gb/572322‑572387

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑