Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	576288	576459	172	90 [0]	[0] 91	nmpC/essD	DLP12 prophage region; ECK0544:JW5078:b0553; truncated outer membrane porin/predicted phage lysis protein

GAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAATT  >  W3110S.gb/576224‑576287                                                                | gagtaaaaataaaTCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:242220/4‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAAGGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1697491/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGTTCTATAAtt  >  1:788225/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:246901/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:39288/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:379102/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:378681/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:344851/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:343001/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:306557/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:301570/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:279073/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:26127/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:25598/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:251586/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:436218/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:20631/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:20170/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:197132/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:188846/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1863341/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1831683/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1808205/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1806353/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:691104/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:952619/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:909769/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:899175/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:870767/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:84930/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:789681/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:752758/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:747692/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:745449/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:721107/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1799259/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:655453/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:630930/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:622458/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:605937/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:558727/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:548542/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:519173/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:51608/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:471207/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:462867/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1213848/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1398986/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1382925/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1372292/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1305164/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1282839/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1274932/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1252826/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1251626/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1240457/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:122717/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1399186/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1175825/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1170573/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1125029/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1124823/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1119914/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1094296/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:108137/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1077483/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1064383/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1059482/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1569283/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1720298/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1702773/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1681941/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1668566/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1664899/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1655309/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1654402/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1650666/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1611677/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1604397/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1013410/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1566035/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1546661/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1511611/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1484168/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1480900/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1459394/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1427979/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1417589/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1417326/1‑64 (MQ=255) gAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAAtt  >  1:1416626/1‑64 (MQ=255)                                                                | GAATAAAAATAAATCTATTAGCCAATTTATATTAACGGCTGTTATTTATAAGTGCTCTATAATT  >  W3110S.gb/576224‑576287

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑