Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	579842	580041	200	48 [0]	[0] 99	ybcW/nohB	hypothetical protein/DNA packaging protein

CGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGT  >  W3110S.gb/579778‑579841                                                                | cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:450827/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1703521/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1007080/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1768137/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1800002/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1844507/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:239979/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:25107/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:254760/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:29978/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:357017/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:410397/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1704283/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:461792/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:467724/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:479817/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:555571/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:556380/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:611644/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:69288/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:785560/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:811473/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:878896/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1365051/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:109870/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1178220/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1207027/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1219405/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1235406/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1252289/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1263639/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1267967/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1278744/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1310159/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1670516/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:140065/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:141556/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1420518/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1439430/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1461058/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1504085/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1646266/64‑1 (MQ=255) cGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1664488/64‑1 (MQ=255)  gTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:1348128/63‑1 (MQ=255)  gTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:224729/63‑1 (MQ=255)  gTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:14618/63‑1 (MQ=255)  gTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:861889/63‑1 (MQ=255)           tGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGt  <  1:38943/54‑1 (MQ=255)                                                                | CGTGGTTTGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGT  >  W3110S.gb/579778‑579841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑