Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	19160	19206	47	70 [0]	[0] 22	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

CTGCTTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCA  >  W3110S.gb/19095‑19159                                                                 | ctgctTCGAATCCACCCACGCAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:63299/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:486986/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:648735/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:628662/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:588458/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:532391/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:530762/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:510619/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:491578/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:663490/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:431671/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:420631/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:292245/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:290343/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:264936/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:252884/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:249918/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1041236/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:759170/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:985001/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:978024/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:889907/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:885655/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:847771/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:790984/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:761856/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:759991/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:245772/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:755122/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:753261/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:745503/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:744462/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:681156/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:675918/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:673089/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1214980/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1428008/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1412827/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1403383/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1390951/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1366476/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1261147/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1252457/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1237846/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1480238/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1192092/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1182735/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1151105/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1127807/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1117211/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1106226/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1074638/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1059265/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1688038/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1835636/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1835003/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1795459/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1781012/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1762695/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1753594/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1717708/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1845005/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1665729/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:158867/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1585685/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1580422/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1574166/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1513004/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCa  >  1:1503236/1‑65 (MQ=255) ctgctTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTCGATATGATCa  >  1:422488/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTGCTTCGAATCCACCCACGAAATGCTGCTGGAGCAATTAAGTCAGCATAAACTGGATATGATCA  >  W3110S.gb/19095‑19159

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑