Missing coverage evidence...
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TTGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAC  >  W3110S.gb/611212‑611275                                                                | ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTTCCGGACCAc  <  1:41833/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:428615/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:986325/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:971954/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:927576/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:862986/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:84464/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:801283/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:760923/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:755230/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:720376/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:704088/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:564896/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:53157/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:460445/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1119844/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:355800/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:258219/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:21532/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1844618/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1842184/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1775172/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1760914/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1741338/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:167757/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1304137/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1228295/64‑1 (MQ=255) ttGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:1164622/64‑1 (MQ=255)  tGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:378191/63‑1 (MQ=255)  tGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAc  <  1:480173/63‑1 (MQ=255)                                                                | TTGGTAATGATGTTAACCACGCCGCCCGCCGCGCCGTTGCCATAACGCGCAGCTGCCGGACCAC  >  W3110S.gb/611212‑611275

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑