Missing coverage evidence...
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GCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGT  >  W3110S.gb/781480‑781543                                                                | gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCCCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1621791/1‑64 (MQ=255) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:531194/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1676425/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1818328/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1856200/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:224476/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:225350/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:295327/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:357204/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:882824/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:600307/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:67693/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:71868/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:751946/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:787524/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:812196/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:851491/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1008534/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1246682/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1050178/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1092112/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1145295/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1192061/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1197003/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1213602/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:122093/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1238419/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1645220/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1251627/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1415813/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1441784/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1472650/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1557619/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGt  >  1:1616935/1‑64 (MQ=35) gcgcAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGCTCGGCGGt  >  1:1502811/1‑64 (MQ=25)                                                                | GCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGT  >  W3110S.gb/781480‑781543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑