Missing coverage evidence...
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ATCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCAA  >  W3110S.gb/787793‑787857                                                                 | aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:676373/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1703648/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1738341/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1742171/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1755675/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1797016/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:184647/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:256909/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:427162/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:436701/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:550549/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:639303/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:161399/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:692520/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:729783/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:731607/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:745067/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:787104/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:797503/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:828855/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:855048/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:964281/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:997497/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1326468/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1078543/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1089041/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1109055/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1120277/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1125321/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1143789/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1217003/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1236634/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:125259/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1260093/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1277898/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1028074/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1337473/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1380901/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1381706/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1412093/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:141738/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1443660/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1471012/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1485620/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:1493544/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:156056/1‑65 (MQ=255) aTCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAACGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCaa  >  1:19625/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCAA  >  W3110S.gb/787793‑787857

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑