Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 42398 42454 57 80 [0] [0] 29 [fixA] [fixA]

AAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAG  >  W3110S.gb/42333‑42397
                                                                |
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:304672/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:447993/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:412863/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:407694/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:390275/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:373491/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:33875/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:332562/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:31973/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:308098/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:451285/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:294919/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:252752/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:247395/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:222598/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:202350/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1022152/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1886725/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1876152/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:736461/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:987047/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:957371/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:901323/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:886943/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:885970/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:808816/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:79314/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:745129/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:200455/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:685850/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:682778/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:610507/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:602918/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:600805/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:519437/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:509030/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:507026/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1257969/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1508290/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1418727/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1417885/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1325579/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1317935/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1310006/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1296848/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:12707/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1846043/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:123856/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1224260/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1164966/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1149901/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1143708/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1116646/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1100218/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1050484/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1701620/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1733929/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1730531/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:172788/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:172512/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1556652/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1707521/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1769759/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1784422/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:164808/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1830490/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1617487/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:156195/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTCTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1449201/65‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGTGACATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:459748/65‑1 (MQ=255)
 taGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:218246/63‑1 (MQ=255)
 aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1055607/64‑1 (MQ=255)
 aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:981104/64‑1 (MQ=255)
 aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1692217/64‑1 (MQ=255)
      cGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1166464/59‑1 (MQ=255)
         gATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1618516/56‑1 (MQ=255)
           tatCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:604452/54‑1 (MQ=255)
            atCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:652653/53‑1 (MQ=255)
                            accGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:1859353/37‑1 (MQ=255)
                             ccGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGgag  <  1:638723/36‑1 (MQ=255)
                                                                |
AAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAG  >  W3110S.gb/42333‑42397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: