Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	885089	885317	229	32 [0]	[0] 26	cmr	multidrug efflux system protein

GCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATG  >  W3110S.gb/885024‑885088                                                                 | gCACGCGTATTTATTGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1604792/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:524529/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1677037/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1792364/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1810992/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1835384/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1844555/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:420543/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:506564/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1650381/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:57633/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:675761/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:767215/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:795193/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:861039/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:86734/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:954065/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1049263/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1584883/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1553868/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1538939/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1447251/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1436415/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1403701/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1333392/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1314252/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1180090/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1157052/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1146811/65‑1 (MQ=255) gCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:1134734/65‑1 (MQ=255)  cACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:15932/64‑1 (MQ=255)                             ttAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATg  <  1:155041/37‑1 (MQ=255)                                                                 | GCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATG  >  W3110S.gb/885024‑885088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑