Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	899385	899406	22	44 [0]	[0] 100	rumB	23S rRNA m(5)U747 methyltransferase

GACTGAAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTGG  >  W3110S.gb/899320‑899384                                                                 | gactgaAAGCCAGAGTGATGGTGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1556265/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGTCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1223272/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:380426/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1782166/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1854624/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:237556/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:298410/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:322737/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:327540/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:349843/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:356725/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1024594/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:536335/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:592596/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:822822/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:855696/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:888932/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:954628/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:955752/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:974595/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1228039/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1002329/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1052762/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1132806/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1198751/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1206755/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1214385/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1631495/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1285725/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1322616/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1380446/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:13954/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1408765/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1522524/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1589945/65‑1 (MQ=255) gactgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGAAACCAAGCTgg  <  1:1329627/65‑1 (MQ=255)  actgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:354027/64‑1 (MQ=255)  actgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:854200/64‑1 (MQ=255)  actgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1587984/64‑1 (MQ=255)  actgaAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:1823573/64‑1 (MQ=255)          ccAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:610133/56‑1 (MQ=255)                        gCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:699644/42‑1 (MQ=255)                         cATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:117721/41‑1 (MQ=255)                               gctgcGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTgg  <  1:668273/35‑1 (MQ=255)                                                                 | GACTGAAAGCCAGAGTGATGGAGGCATGATGCTGCGCTTTGTACTGCGTTCTGATACCAAGCTGG  >  W3110S.gb/899320‑899384

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑