Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	47411	47459	49	19 [0]	[0] 109	kefF	flavoprotein subunit for the KefC potassium efflux system

CTCTTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTCGC  >  W3110S.gb/47346‑47410                                                                 | ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1741092/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:971516/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:886990/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:724008/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:702173/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:486033/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:403160/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:36781/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:283131/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1752918/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:103896/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1677443/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1667227/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1661088/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1614747/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1586272/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1473336/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1417892/1‑65 (MQ=255) ctctTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTcgc  >  1:1397680/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTCTTTATCAACTCTATCCTGACTTCAATATCGATATTGCCGCCGAGCAGGAGGCGCTGTCTCGC  >  W3110S.gb/47346‑47410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑