Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 998588 998659 72 151 [0] [0] 3 ycbQ predicted fimbrial‑like adhesin protein

Only 100 of 151 total aligned reads displayed.

AATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTG  >  W3110S.gb/998523‑998587
                                                                |
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:344061/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:543091/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:523619/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:523135/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:516067/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:474812/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:442557/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:438919/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:412757/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:377600/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:370188/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:357685/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:547098/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:298886/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:293762/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:286781/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:270514/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:258948/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:249252/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:202830/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:193711/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1873666/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1857274/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1033982/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:76167/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:973866/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:906539/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:892898/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:889134/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:888092/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:88160/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:831186/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:8112/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:799494/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:789858/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:776016/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1830850/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:748591/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:735197/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:690207/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:63988/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:624072/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:621530/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:61122/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:605606/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:603369/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:598165/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:571951/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1246332/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1793315/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1346349/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:134423/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1328250/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1326380/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1308656/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1296572/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1282452/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1273424/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1268449/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1258444/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1354020/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1217851/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1197624/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:119427/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1193597/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1178106/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:112889/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1112402/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1096586/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1065154/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1055396/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1034891/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:165245/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1740491/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1732154/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1730056/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1727965/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1723472/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1723332/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1706902/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1695141/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1666348/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1740579/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1587269/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:156204/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:156132/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1544095/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1543114/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1497646/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1494844/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1445907/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1439658/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGCTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1727171/65‑1 (MQ=255)
aaTTGAATTAAAAGATTGCGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:812354/65‑1 (MQ=255)
 aTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1834916/64‑1 (MQ=255)
 aTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1362975/64‑1 (MQ=255)
 aTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1071206/64‑1 (MQ=255)
 aTTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:67083/64‑1 (MQ=255)
    gAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:161112/61‑1 (MQ=255)
             gATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTg  <  1:1807125/52‑1 (MQ=255)
                                                                |
AATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTG  >  W3110S.gb/998523‑998587

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑