Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	55527	55535	9	97 [0]	[0] 3	imp	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity

TCAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCG  >  W3110S.gb/55461‑55526                                                                  | tCAAGACCGCCGTAA‑TCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1560199/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCATAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1856566/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTTGTCATATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:700306/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:411227/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:604820/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:590118/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:541351/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:534403/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:522265/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:509565/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:485598/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:434682/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:426059/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:414686/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:612260/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:354907/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:353630/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:335824/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:29355/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:290867/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:289974/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:277818/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:275559/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:258355/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:247144/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:854266/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:998349/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:986466/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:95/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:945792/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:945395/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:903891/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:895224/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:888314/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:884921/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:875490/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:874738/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1062757/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:820832/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:810879/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:742935/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:706623/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:698544/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:696764/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:681714/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:646660/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:637561/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:615948/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1230490/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1521112/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1491716/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1444329/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1442355/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1437382/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1404564/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1383468/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1351652/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1329841/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1307312/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1271183/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1533270/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:121486/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1176767/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1164270/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1130782/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:112965/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1115656/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:108119/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1079029/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1076180/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1075123/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1058750/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1681052/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:203393/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1883483/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:183870/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1814712/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1811698/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1808898/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1763647/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1744149/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1719267/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1711795/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1648058/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1646962/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1644260/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1627700/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1601460/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1556088/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1538692/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGCCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1701357/65‑1 (MQ=255)  cAAGACCGCCGTAAGTCCGGGCCCGGAACAGGCCAGAGTAGGCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:503721/65‑1 (MQ=255)   aaGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:1786704/64‑1 (MQ=255)   aaGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:581267/64‑1 (MQ=255)   aaGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:151853/64‑1 (MQ=255)           cgTTAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGTGACGAGTCg  <  1:530034/56‑1 (MQ=255)                      tCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCg  <  1:239072/45‑1 (MQ=255)                                                                  | TCAAGACCGCCGTAAGTCCGGTCCCGGAACAGGCCAGAGTAGTCAGATTGCAGCAGAGACGAGTCG  >  W3110S.gb/55461‑55526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑